Não sei muito de loadbalance mais acho que tem que ser do mesmo modo que é feito normamelte vc cria um ip virtual em um de suas interfaces wan e coloca o ip do mikrotik na mesma faixa desse ip e faz um nat no mk para o mk-auth pra que ele tenha acesso a net, sobre o cache-full ver se seu loadbalance não é por marcação de pacotes e ver se ele não esta atralanhando o no mesmo acho que vc fazendo isso já irar resolver, sobre os cadastros tudo fica no mk-auth o mk ira busca no mk sempre que precisa, mais seu mk ter que ter o mesmo secret e ip que foi cadastrado em mikrotiks para que o mesmo tenha acesso o secret é como se fosse uma senha compartinhada entre o mk e o mk-auth vc pode cadastrar quantos mk quiser e estes mikrotik podem estar em qualquer lugar do mundo que se ele tiver acesso ao mk-auth ele busca os dados. Espero ter explicado melhor.
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Pedro Filho